227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3010 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  98.51 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  89.39 
 
 		 132 aa  247  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  78.63 
 
 		 131 aa  216  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  68.22 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  63.93 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  64.46 
 
 		 133 aa  160  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  63.64 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  59.52 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  62.3 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  60.98 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  65.22 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  62.07 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  65.52 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  65.22 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  61.02 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  61.21 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  57.94 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  61.74 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  60.17 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  57.94 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  57.14 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  58.33 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  54.84 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  60.34 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  59.02 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  58.06 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  59.02 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  60.18 
 
 		 117 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  60.55 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  58.62 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  55.47 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  59.82 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  55.17 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  54.1 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  58.12 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0368  aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.574262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  59.82 
 
 		 127 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  51.67 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  52.46 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  56.9 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  56.36 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  51.2 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  53.23 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  52.5 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  55 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  49.19 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  62.61 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  51.2 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>