226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5147 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
135 aa  269  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
135 aa  269  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
135 aa  269  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  86.67 
 
 
135 aa  234  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  84.44 
 
 
134 aa  229  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  82.22 
 
 
139 aa  223  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  80.16 
 
 
156 aa  206  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  74.6 
 
 
165 aa  194  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  80 
 
 
141 aa  191  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  79.17 
 
 
142 aa  190  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  77.05 
 
 
141 aa  188  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  71.21 
 
 
142 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  75.38 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  77.05 
 
 
149 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  76.86 
 
 
135 aa  186  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  70.63 
 
 
135 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  74.59 
 
 
145 aa  185  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  73.77 
 
 
150 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  70.83 
 
 
150 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  72.13 
 
 
138 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  68.85 
 
 
136 aa  174  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  69.23 
 
 
134 aa  174  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  73.33 
 
 
144 aa  173  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  65.08 
 
 
155 aa  173  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  72.13 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  66.13 
 
 
141 aa  167  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  67.21 
 
 
142 aa  167  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  65.6 
 
 
138 aa  166  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 
137 aa  166  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  67.21 
 
 
135 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  65.08 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 
160 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  61.11 
 
 
151 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  61.9 
 
 
154 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
126 aa  157  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  68.14 
 
 
116 aa  156  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  61.48 
 
 
135 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  64.6 
 
 
126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 
128 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  66.06 
 
 
131 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 
134 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  62.93 
 
 
134 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  61.74 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  57.63 
 
 
118 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
118 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 
135 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  140  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  49.22 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  59.48 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  137  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  56.25 
 
 
131 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  55.74 
 
 
131 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 
126 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  56.25 
 
 
131 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  55.47 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 
127 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  53.85 
 
 
126 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  53.85 
 
 
126 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 
127 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  58.93 
 
 
116 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
126 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  54.17 
 
 
126 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
133 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 
117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  56.64 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 
115 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  57.52 
 
 
127 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 
126 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  58.04 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 
116 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  52.99 
 
 
128 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
128 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  55.45 
 
 
128 aa  129  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>