226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3834 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 115 aa  233  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  71.05 
 
 		 114 aa  174  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  73.21 
 
 		 116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  70.43 
 
 		 116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  68.7 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  71.3 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  69.57 
 
 		 117 aa  163  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  63.48 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  65.22 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  62.61 
 
 		 116 aa  150  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  64.66 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  61.74 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  63.16 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  58.56 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  57.89 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  55.86 
 
 		 156 aa  141  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  59.29 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  54.05 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  54.95 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  54.95 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  61.47 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  58.56 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  57.27 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  64.35 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  59.46 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  54.95 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  53.15 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  55.86 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  52.25 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  52.29 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  53.15 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  50.45 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  52.25 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  52.25 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  48.65 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  48.65 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  50.45 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  57.41 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>