227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0135 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  237  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  73.04 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  70.43 
 
 		 115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  70.43 
 
 		 117 aa  167  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  65.52 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  69.72 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  68.1 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  65.79 
 
 		 114 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  64.35 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  62.07 
 
 		 116 aa  153  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  64.04 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  58.77 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 		 115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  62.96 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  60.91 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  55.17 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  58.04 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  58.93 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  55.86 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  55.86 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 		 128 aa  123  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  50.43 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1769  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.25333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  49.14 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  54.95 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  52.59 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>