226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0199 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  79.46 
 
 
115 aa  181  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  73.68 
 
 
115 aa  179  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  73.68 
 
 
115 aa  167  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  64.66 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  62.07 
 
 
121 aa  144  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  62.5 
 
 
128 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  58.41 
 
 
126 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 
125 aa  134  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 
116 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  57.52 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  56.9 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  56.64 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
141 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 
115 aa  130  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
126 aa  130  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 
120 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  53.45 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 
142 aa  127  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  56.25 
 
 
127 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  55.36 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  57.52 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  53.57 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  56.31 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  52.21 
 
 
150 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  50.44 
 
 
126 aa  124  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  55.36 
 
 
117 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 
126 aa  123  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  55.45 
 
 
118 aa  123  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
127 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  48.28 
 
 
142 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  50.89 
 
 
141 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 
131 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 
126 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 
118 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 
116 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  48.28 
 
 
145 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  50.86 
 
 
141 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  54.13 
 
 
154 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  55.86 
 
 
117 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
132 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
141 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
125 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  47.79 
 
 
126 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  48.21 
 
 
116 aa  119  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  48.28 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  47.79 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  50.86 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  50.89 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  48.7 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  46.9 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  52.59 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  52.78 
 
 
135 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  48.67 
 
 
137 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
128 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
128 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
128 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  44.74 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  49.14 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  46.55 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  50.93 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  46.02 
 
 
151 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1682  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
116 aa  114  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  48.21 
 
 
126 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  50.44 
 
 
136 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 
134 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
149 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  47.32 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
128 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  47.41 
 
 
131 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
128 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>