227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0334 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
121 aa  243  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  67.77 
 
 
121 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  67.24 
 
 
115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  63.16 
 
 
128 aa  146  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  64.66 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  62.28 
 
 
115 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
120 aa  140  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  58.97 
 
 
127 aa  139  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
126 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  56.41 
 
 
118 aa  137  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  52.5 
 
 
127 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 
120 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 
120 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  63.16 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  52.99 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 
126 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
116 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  52.54 
 
 
127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  54.13 
 
 
127 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  50.86 
 
 
151 aa  130  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
156 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  57.89 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  59.26 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  54.05 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
127 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
126 aa  127  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  52.5 
 
 
133 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
128 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  54.63 
 
 
131 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 
135 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  50.43 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 
150 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
128 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
135 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
128 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
128 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  48.25 
 
 
127 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 
126 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
135 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  51.75 
 
 
116 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 
126 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 
126 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
125 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  47.93 
 
 
126 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  53.7 
 
 
135 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
120 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 
134 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  51.28 
 
 
141 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  57.14 
 
 
117 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
128 aa  120  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 
142 aa  120  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  53.7 
 
 
139 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 
116 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
128 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 
141 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  52.59 
 
 
128 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
138 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  51.82 
 
 
139 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  45.38 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  48.67 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  52.59 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  51.85 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  51.85 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>