228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1937 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  67.77 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  60.5 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  62.07 
 
 		 114 aa  144  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 115 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  60.5 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  61.54 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  56.67 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  55.74 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  55.74 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  55.74 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  58.97 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 115 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  55.83 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  57.8 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  56.25 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  53.33 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  54.7 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  54.24 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  56.3 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  53.91 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  56.9 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  52.14 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  52.99 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  49.18 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  51.33 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  49.17 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  51.69 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3547  aspartate alpha-decarboxylase  50.83 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  48.36 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  47.54 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2699  aspartate 1-decarboxylase  48.33 
 
 		 127 aa  120  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  47.54 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  46.28 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  48.72 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  48.28 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  47.54 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  46.49 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  48.25 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  47.86 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  46.61 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  52.1 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  46.72 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  47.11 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  50.43 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  46.15 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  48.7 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  48.31 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  46.15 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>