226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3688 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  71.05 
 
 
115 aa  174  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  65.79 
 
 
116 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  67.54 
 
 
116 aa  157  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  69.44 
 
 
118 aa  156  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  64.04 
 
 
126 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  63.16 
 
 
128 aa  150  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
116 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  63.16 
 
 
117 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  61.4 
 
 
116 aa  145  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 
116 aa  142  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
126 aa  142  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  62.83 
 
 
117 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 
127 aa  140  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
115 aa  141  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 
127 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 
135 aa  140  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  58.18 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  59.65 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  59.65 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 
127 aa  136  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 
156 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
115 aa  136  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 
126 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  59.09 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 
150 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 
135 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  59.82 
 
 
127 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
132 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  55.96 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 
116 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
120 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
120 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
149 aa  129  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  55.45 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  56.36 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 
135 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  53.7 
 
 
127 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  53.7 
 
 
127 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  53.21 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  53.21 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  53.21 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  52.29 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 
150 aa  127  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
120 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
134 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  57.28 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  51.82 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  56.31 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 
135 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
131 aa  123  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  49.09 
 
 
142 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 
125 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
142 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
145 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  50.91 
 
 
142 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
165 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 
124 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  57.27 
 
 
128 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  47.37 
 
 
131 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 
127 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  46.49 
 
 
131 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  46.49 
 
 
131 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 
128 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  53.4 
 
 
141 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>