226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0652 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  75.83 
 
 		 120 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  72.5 
 
 		 120 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  73.11 
 
 		 120 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  73.11 
 
 		 120 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  57.98 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  60.17 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  56.78 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  53.78 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  56.2 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  55.37 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  53.78 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  54.24 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  55.46 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  55.46 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  55.46 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  53.39 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  53.39 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  48.7 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  53.85 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  52.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0410  aspartate alpha-decarboxylase  50.41 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  50.42 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  48.31 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>