226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0212 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  99.21 
 
 		 126 aa  259  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  96.03 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  92.86 
 
 		 126 aa  245  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  81.75 
 
 		 126 aa  217  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  81.75 
 
 		 126 aa  216  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  81.75 
 
 		 126 aa  214  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  81.75 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  80.95 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  80.95 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  80.16 
 
 		 126 aa  211  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  79.37 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  56.35 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 126 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  54.4 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  56.1 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  52.42 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  54.76 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  53.97 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  53.97 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  50.79 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  52.46 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  50.79 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  54.55 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  54.76 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  49.22 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  49.19 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  49.19 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2041  aspartate 1-decarboxylase  55.28 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  48.25 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 135 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 135 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 135 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  48.25 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0887  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000407278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  47.37 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>