227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0566 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
126 aa  262  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  72.22 
 
 
126 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  61.9 
 
 
126 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0887  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 
126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000407278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  63.93 
 
 
126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  57.94 
 
 
126 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 
126 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 
129 aa  157  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 
126 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 
126 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 
126 aa  155  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 
126 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 
126 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 
126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 
126 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 
126 aa  150  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 
126 aa  149  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 
135 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 
142 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  53.17 
 
 
127 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  54.03 
 
 
126 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  53.17 
 
 
127 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  50.79 
 
 
137 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  53.17 
 
 
126 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 
128 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2041  aspartate 1-decarboxylase  56.35 
 
 
126 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
133 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 
126 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 
133 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  53.6 
 
 
128 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  53.23 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  52.59 
 
 
120 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  48.41 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  51.59 
 
 
128 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  52 
 
 
128 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  49.19 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  49.21 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  48.41 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  47.62 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  48.41 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  50.42 
 
 
131 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2688  aspartate 1-decarboxylase  52.94 
 
 
127 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40119  normal  0.0325759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3089  aspartate 1-decarboxylase  52.94 
 
 
127 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
120 aa  123  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 
133 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  47.58 
 
 
126 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  47.58 
 
 
126 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  48.25 
 
 
131 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 
126 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  46.49 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  45.61 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  45.61 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  46.61 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  52.29 
 
 
131 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
120 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0368  aspartate 1-decarboxylase  56.41 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.574262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  47.83 
 
 
133 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 
118 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  46.96 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  45.38 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  44.54 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>