226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1013 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1013  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354884  normal  0.0946421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1682  aspartate 1-decarboxylase  61.74 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  47.37 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  50.89 
 
 		 128 aa  116  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3089  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2688  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40119  normal  0.0325759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  50.44 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  47.11 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  49.56 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  48.03 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  50.81 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  49.56 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  51.28 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  49.56 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  50.44 
 
 		 126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  47.37 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  49.56 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  48.62 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  49.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  45.79 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  48.28 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  50.44 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  50.44 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  50.44 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0887  aspartate alpha-decarboxylase  49.55 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000407278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  46.15 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  50.44 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  46.43 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  46.43 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  50.44 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  49.56 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  44.44 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  45.6 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  47.5 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  49.59 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  50.46 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  49.53 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  44.44 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2123  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.244541  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  47.86 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  47.9 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  49.12 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  48.65 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  48.18 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  47.97 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  44.25 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  44.44 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  44.44 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  45.87 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  42.98 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  48.62 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>