136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1518 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1518  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
175 aa  346  1e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000129191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  23.95 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  27.34 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1699  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.29 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.315472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  25.58 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.84 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.84 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.84 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  35.58 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.72 
 
 
184 aa  54.3  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  25.71 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  25.71 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  26.59 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  26.7 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0005  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.84 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
186 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
179 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  31.16 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.1 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.1 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
179 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.12 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.12 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.72 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.92 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  27.93 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4544  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0114562  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  27.93 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.77 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  24.57 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  25.31 
 
 
217 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  47.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.86 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.85 
 
 
177 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
177 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.12 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  23.84 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  30.94 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.51 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.04 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.85 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  24.76 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  31.73 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  27.1 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  27.1 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.19 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>