112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0126 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0126  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  30.08 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  33.6 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  28.03 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  29.01 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  32.26 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  28.36 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  28.24 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  35.85 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  30.28 
 
 
133 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  28.79 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  27.69 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  29.46 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  27.61 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  29.79 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  30.71 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  29.63 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  29.46 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  29.63 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  30.66 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  29.6 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  30.66 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  25.56 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  27.64 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  30.69 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  31.3 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  34.11 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  28.15 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  29.93 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  27.48 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  30.4 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  33 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  25.56 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  25.56 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  25.36 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  27.56 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1030  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  29.93 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  26.4 
 
 
138 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  25 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  27.07 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  25.56 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  25.37 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  32.43 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  26.32 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  29.6 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  25.56 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  27.07 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  28.35 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  27.82 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  29.6 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  28.35 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  27.07 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  25.56 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  27.82 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  29.6 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  26.72 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  26.12 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  25.19 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  28.89 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  28.89 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  27.74 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  22.39 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  28.24 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  28.47 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.48 
 
 
139 aa  43.5  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  28.47 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  28.47 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  25.6 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  28.15 
 
 
324 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.15 
 
 
324 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  26.77 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  28.85 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  34.67 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  27.01 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2131  PTS system fructose subfamily IIA component  29.37 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3696  PTS system fructose subfamily IIA component  27.2 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000385193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3474  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.155364  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.41 
 
 
324 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  27.88 
 
 
322 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 
322 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 
322 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>