98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3696 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3696  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000385193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1665  PTS system fructose subfamily IIA component  34.38 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  33.59 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  33.81 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  33.87 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  28.91 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  28.91 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  28.91 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  29.58 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  28.87 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  26.98 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  28.87 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  28.87 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  28.87 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  28.87 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  28.87 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  28.17 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  30.16 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  32.09 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  36.73 
 
 
314 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5497  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  28.46 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4480  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  29.27 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  28.36 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  30.4 
 
 
330 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  26.96 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  26.95 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  32.65 
 
 
329 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.27 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.69 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  28.69 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.69 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  30.4 
 
 
336 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.69 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.69 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.63 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  35.14 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0400  PTS system fructose IIA subunit  33.33 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.37 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4522  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  26.02 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.87 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  28.69 
 
 
320 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4102  PTS system fructose IIA component  25.93 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4051  PTS system fructose-specific transporter subunit IIA  25.93 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0648289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3979  PTS system fructose IIA component  25.93 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3997  PTS system fructose IIA component  25.93 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4165  PTS system fructose transporter subunit IIA  25.93 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.315728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4281  PTS system fructose subfamily IIA component  36 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  35.62 
 
 
332 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  27.87 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.87 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0404  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  31.88 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.69 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  33.33 
 
 
329 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  30.95 
 
 
326 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.87 
 
 
324 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.99 
 
 
326 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1658  PTS system fructose subfamily IIA component  25.53 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.780383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.05 
 
 
322 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3277  PTS system fructose IIA component  26.72 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  28.16 
 
 
322 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  28.28 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  25.47 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.78 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1204  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.14 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  27.91 
 
 
323 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  36.99 
 
 
332 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.05 
 
 
318 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  26.36 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  25.66 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  26.83 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  26.23 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  27.62 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  26.61 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0126  PTS system fructose subfamily IIA component  27.2 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500758 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25.2 
 
 
331 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  30.47 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  25.81 
 
 
133 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  25.41 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  25.41 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3953  PTS system fructose subfamily IIA component  25.71 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.808645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  25.81 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  25.81 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  25.81 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3429  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  30.26 
 
 
135 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  26.13 
 
 
133 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  25.81 
 
 
133 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  26.5 
 
 
136 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>