110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3474 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3474  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.155364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4890  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  35.42 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.819144  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4943  PTS system fructose subfamily IIA component  35.42 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4949  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  35.42 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.273021  normal  0.330081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4789  PTS system fructose subfamily IIA component  35.42 
 
 
140 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0517  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.87 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000842573  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1717  PTS system, IIA component  34.96 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3953  PTS system fructose subfamily IIA component  33.8 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.808645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  36.59 
 
 
136 aa  67  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1951  PTS system, IIA component, putative  34.65 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0630  putative PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.87 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0689  putative PTS system mannose-specific enzyme iiab  28.87 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190711  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.19 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.65 
 
 
329 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.3 
 
 
314 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  27.21 
 
 
326 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3255  PTS system fructose subfamily IIA component  30.15 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.622131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  29.29 
 
 
326 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  32.04 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  30.51 
 
 
330 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  30.3 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  34.95 
 
 
133 aa  57.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  28.87 
 
 
336 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  24.63 
 
 
331 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  30.65 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.37 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  29.32 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  33.98 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  24.81 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  25.93 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  30.1 
 
 
329 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1317  PTS system fructose subfamily IIA component  28.35 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.358134  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  32.38 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  27.05 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  23.48 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.91 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  32.04 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  28.16 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  32.04 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  26.17 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  29.52 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  32.38 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  30.48 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  25.87 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  24.75 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  29.58 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  30.28 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  28.83 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  28.7 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  28.7 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  26.23 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  27.52 
 
 
323 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  27.18 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  30.33 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  23.77 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  25.22 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  23.77 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  31.25 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  23.77 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  27.18 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  28.16 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  25.74 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  27.2 
 
 
132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  27.2 
 
 
132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  28 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  28 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  27.56 
 
 
147 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  27.72 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.2 
 
 
332 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  23.85 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  27.59 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  26 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  25.93 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  25.96 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  28.85 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  26.17 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2437  PTS system fructose subfamily IIA component  25.71 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060686  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  28.85 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  28.85 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  25.24 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  27.05 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  28.85 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0126  PTS system fructose subfamily IIA component  31.19 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  26.79 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.85 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  24.51 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  20.79 
 
 
165 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  26.81 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  23.16 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  26.42 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  28.16 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>