48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0517 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0517  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  100 
 
 		 143 aa  293  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000842573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4890  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  31.43 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.819144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4943  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4949  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  31.43 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.273021  normal  0.330081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4789  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3474  PTS system fructose subfamily IIA component  32.87 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.155364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3953  PTS system fructose subfamily IIA component  30.88 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.808645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1717  PTS system, IIA component  30.07 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1951  PTS system, IIA component, putative  29.29 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0689  putative PTS system mannose-specific enzyme iiab  30.77 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0630  putative PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  30.77 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3255  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.622131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1317  PTS system fructose subfamily IIA component  28.28 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.358134  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  28.12 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  32.82 
 
 		 330 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.27 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  27.94 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  27.94 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  27.94 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  27.94 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  27.94 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  32.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  27.94 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  26.47 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  30.43 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.82 
 
 		 329 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  25.85 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3429  PTS system fructose subfamily IIA component  27.08 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  27.21 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  28.26 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  29.35 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  29.35 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  29.35 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  25.4 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  28.26 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  26.95 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  32.26 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  31.25 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  31.52 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  28.8 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  28.8 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.08 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.43 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  26.88 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  36.36 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  29.29 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  22.92 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  27.42 
 
 		 133 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>