111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1273 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  100 
 
 
143 aa  284  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1204  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  48.91 
 
 
100 aa  100  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3429  PTS system fructose subfamily IIA component  35.46 
 
 
141 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1317  PTS system fructose subfamily IIA component  34.03 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.358134  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3255  PTS system fructose subfamily IIA component  28.19 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.622131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  35.64 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  27.54 
 
 
326 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  33.65 
 
 
332 aa  61.6  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.01 
 
 
326 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  22.86 
 
 
330 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  24.03 
 
 
329 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  23.36 
 
 
336 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.77 
 
 
331 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  27.78 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  25.62 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.67 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  24.81 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  26.21 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3696  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000385193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.46 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  28.46 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.46 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.46 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.46 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  26.45 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0517  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.27 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000842573  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  26.36 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  26.36 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  24.6 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.74 
 
 
313 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1665  PTS system fructose subfamily IIA component  22.9 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  29.93 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2248  PTS system fructose subfamily IIA component  21.28 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.88 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2862  PTS system fructose subfamily IIA component  21.28 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.454457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  28.46 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0441  PTS system fructose subfamily IIA component  21.28 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2873  PTS system fructose subfamily IIA component  21.28 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534201  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  27.69 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  27.42 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6191  PTS system fructose subfamily IIA component  20.57 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  21.28 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  21.28 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.07 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.7 
 
 
329 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  29.01 
 
 
323 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  26.56 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3213  PTS system, fructose-specific IIA component  20.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0187  PTS system, fructose-specific IIA component  20.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1405  PTS system, fructose-specific IIA component  20.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0472  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  20.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0491  PTS system mannose/fructose/sorbose (Man) family IIA subunit  20.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2832  PTS system, fructose-specific IIA component  20.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  29.91 
 
 
130 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0656  PTS system, fructose-specific IIA component  20.98 
 
 
219 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  24.75 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4480  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  27.01 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5497  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  25.19 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0411  PTS system, fructose-specific IIA component  21.01 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.666556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  29.1 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  27.35 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  25.53 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.86 
 
 
324 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4281  PTS system fructose subfamily IIA component  27.36 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  25.22 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  25.22 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  26.09 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  25.19 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  27.83 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  26.26 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  27.86 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.86 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  22.9 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  24.35 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  24.35 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  22.94 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  24.35 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0404  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  23.39 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  27.84 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0400  PTS system fructose IIA subunit  24.19 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  26.56 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  28.43 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  31.15 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.07 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  26.56 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  24.79 
 
 
138 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>