93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3255 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3255  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.622131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3429  PTS system fructose subfamily IIA component  35.37 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1317  PTS system fructose subfamily IIA component  30.87 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.358134  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.19 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  37.17 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3474  PTS system fructose subfamily IIA component  30.15 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.155364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.71 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  28.44 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  28.37 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0517  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000842573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.93 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  31.07 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  29.09 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  31.03 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  29.25 
 
 		 331 aa  53.9  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4949  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  25.17 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.273021  normal  0.330081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4943  PTS system fructose subfamily IIA component  25.17 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4890  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  25.17 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.819144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  30.3 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  31.62 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  29.25 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  29.2 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.11 
 
 		 326 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  32.11 
 
 		 326 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  27.13 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  27.97 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.18 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  27.69 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  27.74 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  26.72 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  24.49 
 
 		 330 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0689  putative PTS system mannose-specific enzyme iiab  28.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0630  putative PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4789  PTS system fructose subfamily IIA component  24.5 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.47 
 
 		 332 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  30.6 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  27.36 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  24.82 
 
 		 336 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  25.56 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  29.25 
 
 		 314 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.28 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  28.47 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  26.12 
 
 		 322 aa  47.8  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  28.45 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  26.56 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  27.07 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  26.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1685  PTS system, IIA component  25.17 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0318  PTS system fructose subfamily IIA component  25.17 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.818339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1665  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  25.71 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  25.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  26.67 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  28.03 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  25.19 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1204  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.77 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  23.81 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  28.16 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  23.74 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  25 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  22.9 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  24.26 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  25 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.19 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  26.42 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  29.63 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  28.07 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2561  PTS system fructose subfamily IIA component  24.48 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  23.31 
 
 		 313 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  24.55 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  30.09 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1717  PTS system, IIA component  28.95 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  26.42 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  30.65 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  30.65 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  30.65 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  30.65 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  30.65 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  28.23 
 
 		 144 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  25.71 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  27.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  30.65 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  24.58 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  22.86 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 		 172 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  25.47 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  23.91 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>