135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0540 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00453  tRNA 2-selenouridine synthase, selenophosphate-dependent  98.08 
 
 		 364 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3109  tRNA 2-selenouridine synthase  98.08 
 
 		 364 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00458  hypothetical protein  98.08 
 
 		 364 aa  736    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0546  tRNA 2-selenouridine synthase  98.08 
 
 		 364 aa  738    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3119  tRNA 2-selenouridine synthase  97.8 
 
 		 364 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0437  tRNA 2-selenouridine synthase  97.53 
 
 		 364 aa  734    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  97.8 
 
 		 364 aa  736    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0540  tRNA 2-selenouridine synthase  100 
 
 		 364 aa  752    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0604  tRNA 2-selenouridine synthase  98.08 
 
 		 364 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0567  tRNA 2-selenouridine synthase  77.47 
 
 		 364 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0562  tRNA 2-selenouridine synthase  77.2 
 
 		 364 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0560  tRNA 2-selenouridine synthase  76.92 
 
 		 364 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.556907  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0621  tRNA 2-selenouridine synthase  77.2 
 
 		 364 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.545594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  78.09 
 
 		 361 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0975  tRNA 2-selenouridine synthase  71.27 
 
 		 356 aa  534  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  58.06 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0769  tRNA 2-selenouridine synthase  48.33 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0285  tRNA 2-selenouridine synthase  48.73 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  46.5 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4714  tRNA 2-selenouridine synthase  47.31 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  47.19 
 
 		 376 aa  331  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  45.89 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  46.22 
 
 		 369 aa  325  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0134  tRNA 2-selenouridine synthase  46.2 
 
 		 372 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  45.66 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3619  tRNA 2-selenouridine synthase  44.96 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43270  tRNA 2-selenouridine synthase  47.38 
 
 		 369 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.829954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0863  tRNA 2-selenouridine synthase  47.77 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  45.83 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  46.07 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3629  tRNA 2-selenouridine synthase  47.11 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  45.18 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4364  tRNA 2-selenouridine synthase  46.56 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307655  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  46.07 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  45.25 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  45.79 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  45.53 
 
 		 368 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  45.81 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0176  tRNA 2-selenouridine synthase  44.69 
 
 		 368 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  44.72 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  46.28 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0822  tRNA 2-selenouridine synthase  46.09 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0849  tRNA 2-selenouridine synthase  46.09 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  44.92 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3754  tRNA 2-selenouridine synthase  45.68 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0900033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1622  tRNA 2-selenouridine synthase  45.03 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10190  tRNA 2-selenouridine synthase  45.6 
 
 		 370 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2454  tRNA 2-selenouridine synthase  46.56 
 
 		 373 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  40.73 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0512  tRNA 2-selenouridine synthase  43.73 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  39.28 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  39.72 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  37.24 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  38.11 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  33.14 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  33.05 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  34.6 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  34.57 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  34.24 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  33.64 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  34.01 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  32.35 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  36.5 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  29.97 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  33.63 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  35.33 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  33.04 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  34.02 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  31.1 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  35.97 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  32.1 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  30.42 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  32.59 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  32.63 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  32.94 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  31.82 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  37.02 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  38.26 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  33.44 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  35.22 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  29.97 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  37.83 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  29.94 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  29.94 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0816  rhodanese domain-containing protein  31.14 
 
 		 365 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  29.88 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  29.69 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  29.39 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  31.8 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  29.66 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  35.61 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  29.38 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  29.53 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  30.59 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  31.02 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  32.18 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  34.13 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  29.46 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  35.25 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>