150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0789 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0789  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  100 
 
 
133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.620763  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0286  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  72.18 
 
 
133 aa  207  4e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0843854  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0972  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.94 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1548  CcmE/CycJ protein  41.09 
 
 
153 aa  114  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1210  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.18 
 
 
148 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1514  CcmE/CycJ protein  40.91 
 
 
144 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0586  CcmE/CycJ protein  43.94 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.64 
 
 
155 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4769  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.36 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2389  CcmE/CycJ protein  39.55 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000465809  hitchhiker  0.0000169604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0940  CcmE/CycJ protein  37.4 
 
 
160 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4000  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.98 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0041  CcmE/CycJ protein  41.35 
 
 
147 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1581  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.09 
 
 
151 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1368  CcmE/CycJ protein  37.31 
 
 
149 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0036  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.69 
 
 
153 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45330  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.09 
 
 
162 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3848  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.09 
 
 
162 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1682  CcmE/CycJ protein  37.98 
 
 
173 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2957  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.09 
 
 
151 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1407  CcmE/CycJ protein  37.98 
 
 
177 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  0.044054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3995  CcmE/CycJ protein  43.08 
 
 
153 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60024  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.39 
 
 
156 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.534215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1402  CcmE/CycJ protein  37.98 
 
 
169 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0579765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1656  CcmE/CycJ protein  38.28 
 
 
159 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0590043  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2109  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.21 
 
 
166 aa  100  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3649  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.77 
 
 
151 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1379  CcmE/CycJ protein  41.67 
 
 
144 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2851  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.85 
 
 
156 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846443  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0437  CcmE/CycJ protein  37.98 
 
 
166 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.898696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3072  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.98 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1192  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.31 
 
 
162 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164675  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2445  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.09 
 
 
156 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.76 
 
 
175 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4992  CcmE/CycJ protein  35.88 
 
 
170 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000144292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4167  CcmE/CycJ protein  37.4 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.97506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3411  CcmE/CycJ protein  42.31 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2231  CcmE/CycJ protein  37.4 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1438  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.53 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4432  CcmE/CycJ protein  37.4 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4026  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1956  CcmE/CycJ protein  40.46 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2787  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.76 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2476  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0523388  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1825  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.43 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.153118  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2490  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1517  CcmE/CycJ protein  36.36 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4043  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4147  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4323  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.37 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2933  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.64 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.601085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2434  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
159 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.614283 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4098  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
159 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0397  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.58 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.322278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1544  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.37 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3892  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.37 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332618  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2345  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.666596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02124  periplasmic heme chaperone  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1462  CcmE/CycJ protein  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02083  hypothetical protein  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0898  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.88 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1686  CcmE/CycJ protein  38.81 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2593  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.257893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0744  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2496  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4205  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1453  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.53 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06066  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.12 
 
 
156 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00861  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.12 
 
 
156 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3631  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.53 
 
 
157 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3020  CcmE/CycJ protein  38.24 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.01 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4057  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.29 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30033  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0607  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.01 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2385  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1212  CcmE/CycJ protein  39.23 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2670  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.22 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.61 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3252  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.75 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0373  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.94 
 
 
162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.94 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00217  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.62 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3501  CcmE/CycJ protein  34.88 
 
 
156 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0634  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.38 
 
 
150 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361156  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1363  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.15 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.377712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1500  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2703  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.84 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.679884  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1641  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.26 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.82 
 
 
161 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2420  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  33.82 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  33.59 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0593927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2945  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.13 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2277  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.07 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3989  CcmE/CycJ protein  31.82 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.244243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>