151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2703 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2703  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  100 
 
 
153 aa  308  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.679884  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06066  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  72.19 
 
 
156 aa  200  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00861  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  72.19 
 
 
156 aa  200  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145358  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1621  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  54.01 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.376219  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1564  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  51.82 
 
 
142 aa  154  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1581  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.22 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3848  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.21 
 
 
162 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2957  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.58 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00217  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.64 
 
 
156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.03 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45330  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.52 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1825  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.54 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.153118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1956  CcmE/CycJ protein  44.67 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.11 
 
 
175 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.72 
 
 
153 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2109  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.18 
 
 
166 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2787  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.37 
 
 
161 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3631  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.37 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2389  CcmE/CycJ protein  44.06 
 
 
148 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000465809  hitchhiker  0.0000169604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3649  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.96 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3411  CcmE/CycJ protein  42.25 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4147  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.9 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1870  cysteinyl-tRNA synthetase, class Ia  42.14 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4098  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.9 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4026  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.9 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2490  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.9 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2476  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.9 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0523388  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.92 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2434  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.9 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.614283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.95 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.95 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.377712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1500  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.95 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4769  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.77 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2445  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.8 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2385  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.22 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4323  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.29 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2851  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.36 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846443  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1544  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.29 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2277  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.15 
 
 
146 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3892  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.57 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.95 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1656  CcmE/CycJ protein  47.02 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0590043  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4205  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.84 
 
 
166 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2593  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.84 
 
 
166 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.257893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1192  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.18 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164675  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30410  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.91 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0397  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.322278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4043  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.22 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2345  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.5 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.666596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0259  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0227  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0228693  unclonable  0.0000000000264125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0222  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0227  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153064  unclonable  0.0000000000366599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0437  CcmE/CycJ protein  46.48 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.898696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02124  periplasmic heme chaperone  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1462  CcmE/CycJ protein  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1363  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.85 
 
 
149 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02083  hypothetical protein  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0744  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2496  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1453  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.5 
 
 
159 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1124  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.14 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3573  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.33 
 
 
163 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.075405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE heme chaperone  40.41 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2670  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.62 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2945  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.04 
 
 
151 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1438  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.48 
 
 
162 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4028  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
162 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.781991  hitchhiker  0.0000000663113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3252  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.12 
 
 
164 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0241  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.33 
 
 
162 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  hitchhiker  0.000102983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0224  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
162 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.67 
 
 
151 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0593927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0227  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
162 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141464  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1210  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.44 
 
 
148 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2420  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.29 
 
 
160 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3072  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.48 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0224  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.45 
 
 
162 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0898  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.77 
 
 
144 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.54 
 
 
156 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.534215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.73 
 
 
161 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1591  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.91 
 
 
151 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_004310  BR0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.11 
 
 
165 aa  103  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0607  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.11 
 
 
165 aa  103  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2933  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.89 
 
 
173 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.601085 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0286  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.89 
 
 
133 aa  103  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0843854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0940  CcmE/CycJ protein  46.38 
 
 
160 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4000  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 
147 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03070  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.04 
 
 
164 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.884076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1517  CcmE/CycJ protein  41.98 
 
 
145 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3020  CcmE/CycJ protein  40.97 
 
 
155 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3731  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.13 
 
 
162 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0433902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1368  CcmE/CycJ protein  41.35 
 
 
149 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1641  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 
160 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3989  CcmE/CycJ protein  44.78 
 
 
155 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0634  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.06 
 
 
150 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361156  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.17 
 
 
143 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0211  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.16 
 
 
162 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>