131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0522 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0522  electron transport complex protein RnfC, putative  100 
 
 
401 aa  818    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1238  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  59.64 
 
 
439 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0581  electron transport complex protein RnfC, putative  42.04 
 
 
398 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.42 
 
 
398 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.712418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0065  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.72 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  26.69 
 
 
846 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0528  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.17 
 
 
427 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1061  electron transport complex protein RnfC  28.43 
 
 
659 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  29.14 
 
 
698 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19250  electron transport complex protein RnfC  29.08 
 
 
688 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  28.42 
 
 
842 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1832  electron transport complex protein RnfC  25.34 
 
 
880 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  28.78 
 
 
698 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  27.18 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  28.78 
 
 
659 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3234  electron transport complex protein RnfC  26.95 
 
 
573 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  26.76 
 
 
870 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1733  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  23.9 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0269079  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.11 
 
 
443 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1819  electron transport complex protein RnfC  28.28 
 
 
673 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000614228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.42 
 
 
609 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  27.08 
 
 
784 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  30.25 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0736  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.28 
 
 
857 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200511  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  29.69 
 
 
735 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0379557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  29.69 
 
 
735 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  29.69 
 
 
732 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  29.69 
 
 
735 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  29.69 
 
 
704 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  28.11 
 
 
558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  28.57 
 
 
745 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  28.57 
 
 
944 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2239  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.6 
 
 
703 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000974734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1081  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.65 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0983161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.95 
 
 
673 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.49 
 
 
440 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  25.17 
 
 
825 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14350  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.97 
 
 
441 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000459992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  26.95 
 
 
737 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.37 
 
 
981 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  27.56 
 
 
776 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  26.95 
 
 
747 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.49 
 
 
740 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
740 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  27.49 
 
 
694 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
740 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
740 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
740 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  25.52 
 
 
888 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
676 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
772 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  27.49 
 
 
708 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.76 
 
 
440 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  25.52 
 
 
876 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  25.96 
 
 
731 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  25.17 
 
 
788 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  24.03 
 
 
884 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  24.03 
 
 
884 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50960  Electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.12 
 
 
496 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  25.7 
 
 
885 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  26.6 
 
 
716 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  25.17 
 
 
809 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  25.52 
 
 
790 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.5 
 
 
673 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  25.17 
 
 
799 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  25.17 
 
 
793 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  24.83 
 
 
852 aa  106  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.96 
 
 
443 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2628  electron transport complex protein RnfC  26.65 
 
 
532 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0974  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  23.61 
 
 
438 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0539  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.36 
 
 
438 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.56 
 
 
439 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.88 
 
 
438 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.5 
 
 
435 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.08 
 
 
435 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18920  electron transport complex protein RnfC  27.21 
 
 
774 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000329645  normal  0.0619935 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.04 
 
 
517 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  25.45 
 
 
570 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.18 
 
 
567 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  27.05 
 
 
517 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.79 
 
 
435 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0285  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.3 
 
 
506 aa  99.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.81 
 
 
441 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  23.49 
 
 
912 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  23.86 
 
 
916 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.58 
 
 
503 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.35 
 
 
440 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0888227  normal  0.012306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1792  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.12 
 
 
541 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273011 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.64 
 
 
519 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2593  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.64 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  29.24 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.45 
 
 
890 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.14 
 
 
605 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0342  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.37 
 
 
445 aa  96.3  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0211  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.88 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.92 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0814  electron transport complex protein RnfC  28.85 
 
 
515 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.338019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  28.28 
 
 
788 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.19 
 
 
437 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31 
 
 
441 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>