59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1868 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1868  TOPRIM domain protein  100 
 
 
316 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000467219  normal  0.15683 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5313  DNA primase  30.72 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  26.53 
 
 
539 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  23.7 
 
 
614 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  23.91 
 
 
595 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  24.83 
 
 
612 aa  60.5  0.00000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  23.6 
 
 
595 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  23.39 
 
 
600 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  22.74 
 
 
595 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  29.68 
 
 
592 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  28.24 
 
 
597 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  23.08 
 
 
617 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.91 
 
 
604 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  22.46 
 
 
577 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  23.84 
 
 
660 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  32.45 
 
 
601 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  24.25 
 
 
630 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  24.15 
 
 
577 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  24.56 
 
 
583 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  23.08 
 
 
619 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  24.56 
 
 
583 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  24.46 
 
 
578 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  22.85 
 
 
452 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  23.95 
 
 
582 aa  50.4  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  22 
 
 
634 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  23.78 
 
 
673 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  23.22 
 
 
640 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  24.15 
 
 
592 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  22.95 
 
 
646 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  24.53 
 
 
584 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  22.95 
 
 
646 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  23.2 
 
 
657 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  22.73 
 
 
656 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08280  hypothetical protein  34.52 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.954318  normal  0.0185272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  24.83 
 
 
623 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1591  hypothetical protein  24.7 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  27.69 
 
 
596 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  23.01 
 
 
646 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  20.78 
 
 
641 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  28 
 
 
798 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  23 
 
 
660 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  21.84 
 
 
544 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  23.59 
 
 
632 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  28.38 
 
 
605 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  34.48 
 
 
705 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  31.54 
 
 
642 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0485  DNA primase  23.91 
 
 
595 aa  43.5  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  32.65 
 
 
611 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  27.33 
 
 
741 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  22.82 
 
 
601 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.04 
 
 
593 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  23.03 
 
 
704 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  25.69 
 
 
588 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  29.93 
 
 
548 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  24.38 
 
 
531 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  23 
 
 
633 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  28.57 
 
 
598 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  34.19 
 
 
576 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  22.37 
 
 
574 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>