15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1591 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1591  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  765    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  26.64 
 
 
579 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  23.78 
 
 
600 aa  54.7  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  22.49 
 
 
607 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  26.77 
 
 
539 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  25.08 
 
 
552 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  22.34 
 
 
454 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  25 
 
 
636 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1868  TOPRIM domain protein  24.7 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000467219  normal  0.15683 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  24.38 
 
 
601 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  20.58 
 
 
598 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  24.23 
 
 
619 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  31.73 
 
 
593 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  23.43 
 
 
583 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  21.02 
 
 
626 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>