46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2768 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1090    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  31.94 
 
 		 592 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  32.79 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  31.04 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  27.1 
 
 		 610 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  26.08 
 
 		 607 aa  93.2  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  26.46 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.59 
 
 		 610 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2325  DnaB domain protein helicase domain protein  28.19 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0591718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  26.96 
 
 		 788 aa  60.5  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1320  DnaB domain-containing protein  27.51 
 
 		 470 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0545947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1377  DnaB domain protein helicase domain protein  27.13 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0470845  hitchhiker  0.00000000022728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0079  primary replicative DNA helicase  23.71 
 
 		 473 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.533347  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  23.84 
 
 		 646 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  23.65 
 
 		 471 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  23.53 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  23.53 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  23.53 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0097  replicative DNA helicase  23.71 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.100227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  25.34 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  24.22 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0085  replicative DNA helicase  23.71 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  22.66 
 
 		 460 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0129  replicative DNA helicase  20.71 
 
 		 485 aa  47.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  22.66 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  26.13 
 
 		 544 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  21.67 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  24.2 
 
 		 450 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  23.9 
 
 		 465 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  22.91 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  23.98 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  23.42 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  23.53 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  22.91 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  22.22 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  22.66 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  23.53 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  23.67 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  22.58 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  23.25 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  23.58 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  21.59 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  23.29 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  23.25 
 
 		 464 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  23.51 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  22.73 
 
 		 498 aa  43.5  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>