69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0053 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 601 aa  1245    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  43.4 
 
 		 592 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  31.75 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  31.04 
 
 		 531 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  26.58 
 
 		 597 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  25.15 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  24.86 
 
 		 607 aa  107  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  29.21 
 
 		 646 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.22 
 
 		 610 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  27.37 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  25.24 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  27.15 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  27.74 
 
 		 444 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  27.82 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  25 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  25 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  25.52 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  23.03 
 
 		 342 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  22.32 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  24.76 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  24.58 
 
 		 468 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2432  DnaB domain protein helicase domain protein  22.38 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1868  TOPRIM domain protein  32.45 
 
 		 316 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000467219  normal  0.15683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  23.24 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  23.89 
 
 		 468 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  23.89 
 
 		 468 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  23.89 
 
 		 468 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  23.89 
 
 		 468 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1377  DnaB domain protein helicase domain protein  22.38 
 
 		 437 aa  50.4  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0470845  hitchhiker  0.00000000022728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  24.61 
 
 		 471 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  24.56 
 
 		 461 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  25 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  24.29 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  24.2 
 
 		 468 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1024  replicative DNA helicase  23.81 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.916130000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  24.54 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1111  replicative DNA helicase  24.18 
 
 		 428 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.229668  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  24.42 
 
 		 468 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  23.88 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1028  replicative DNA helicase  24.18 
 
 		 428 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0129  replicative DNA helicase  23.13 
 
 		 485 aa  48.5  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  24.47 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0840  replicative DNA helicase  24.18 
 
 		 431 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.337638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0880  replicative DNA helicase  23.47 
 
 		 431 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0934  replicative DNA helicase  23.47 
 
 		 428 aa  47.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4330  replicative DNA helicase  23.1 
 
 		 429 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.115603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  22.41 
 
 		 446 aa  47  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0983  replicative DNA helicase  23.44 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  22.43 
 
 		 479 aa  47  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3955  DnaB domain-containing protein  22.82 
 
 		 460 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0029  DnaB helicase  23.79 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0026  DnaB domain protein  20.8 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  21.98 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  21.98 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0832  replicative DNA helicase  23.81 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  28.62 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  22.86 
 
 		 471 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0849  replicative DNA helicase  23.44 
 
 		 431 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1873  DnaB domain-containing protein  24.14 
 
 		 465 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  19.68 
 
 		 470 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  21.85 
 
 		 447 aa  44.3  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  22.22 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>