29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0913 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  100 
 
 		 342 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  36.2 
 
 		 610 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  38.56 
 
 		 597 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  32.52 
 
 		 610 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  32.38 
 
 		 788 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1933  hypothetical protein  35.4 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262327  hitchhiker  0.000000452368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  25.61 
 
 		 607 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  23.45 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  22.41 
 
 		 601 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  22.41 
 
 		 544 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  27.57 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  25.27 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  27.17 
 
 		 486 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  22.86 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  25.13 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  25.65 
 
 		 478 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  25.13 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  26.63 
 
 		 483 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  25.13 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  27.17 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  26.63 
 
 		 495 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  30.91 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  37.1 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  40.74 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 230 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  26.63 
 
 		 503 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>