26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1933 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262327  hitchhiker  0.000000452368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  37.67 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  38.23 
 
 		 597 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  37.32 
 
 		 610 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  32.58 
 
 		 788 aa  144  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  35.4 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  25.73 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  24 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23140  DnaB domain protein helicase domain protein  23.95 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  25.6 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  24.34 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  24.34 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1371  replicative DNA helicase  23.6 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  20.65 
 
 		 461 aa  53.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  24.52 
 
 		 601 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3220  DnaB domain-containing protein  24.59 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150384  normal  0.300928 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  21.6 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  22.87 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1873  DnaB domain-containing protein  23.56 
 
 		 465 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  21.03 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  25.28 
 
 		 497 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0229  DnaB domain-containing protein  24.51 
 
 		 500 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.594678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3126  DnaB domain-containing protein  19.68 
 
 		 419 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  21.51 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  21.94 
 
 		 470 aa  42.7  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  23.04 
 
 		 508 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>