116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3911 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  100 
 
 		 607 aa  1240    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  30.65 
 
 		 597 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  27.62 
 
 		 610 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  26.53 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  26.63 
 
 		 610 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  24.86 
 
 		 601 aa  107  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  29.01 
 
 		 788 aa  99.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  22.45 
 
 		 646 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  26.08 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  25.61 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  23.03 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1933  hypothetical protein  25.73 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262327  hitchhiker  0.000000452368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  24.68 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  22.15 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  24.02 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  24.09 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  24.09 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  22.87 
 
 		 577 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  21.07 
 
 		 448 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  48 
 
 		 446 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  22.37 
 
 		 468 aa  51.2  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  22.87 
 
 		 578 aa  50.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  21.83 
 
 		 468 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  28.22 
 
 		 595 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  23.96 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  22.71 
 
 		 468 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  20.88 
 
 		 676 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  22.71 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  22.47 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  23.6 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  22.67 
 
 		 461 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  32.18 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  23.83 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  23.08 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  21.11 
 
 		 660 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  22.34 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  22.34 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  22.34 
 
 		 468 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  22.83 
 
 		 594 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  20.4 
 
 		 645 aa  48.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  23.05 
 
 		 500 aa  48.1  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  52.94 
 
 		 448 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  21.9 
 
 		 450 aa  47.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  23.08 
 
 		 629 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  51.16 
 
 		 494 aa  47  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  22.73 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  22.73 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  22.85 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  19.77 
 
 		 592 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  22.02 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  23.83 
 
 		 463 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  23.97 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  30.51 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  23.97 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  22.9 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  34.67 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  21.74 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  22.63 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  24.57 
 
 		 625 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  23.68 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  22.46 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  21.9 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  22.74 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  23.68 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  22.46 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  22.46 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  29.71 
 
 		 641 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  25.49 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  22.46 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  22.63 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  25.38 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  23.64 
 
 		 449 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  26.4 
 
 		 621 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  25 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  21.59 
 
 		 669 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  32.94 
 
 		 457 aa  45.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  51.16 
 
 		 454 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  22.59 
 
 		 460 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  28.45 
 
 		 453 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  23.76 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  31.94 
 
 		 652 aa  44.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  30.38 
 
 		 466 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  22.7 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  22.78 
 
 		 461 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  22.59 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  22.59 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  18.22 
 
 		 437 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  21.9 
 
 		 468 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  23.24 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  22.78 
 
 		 461 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1720  replicative DNA helicase  21.18 
 
 		 458 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  24.54 
 
 		 449 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  27.7 
 
 		 647 aa  43.9  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  32.93 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>