12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3347 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 515 aa  1061    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  34.42 
 
 		 592 aa  260  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  31.75 
 
 		 601 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  32.79 
 
 		 531 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  25.23 
 
 		 646 aa  83.2  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  24.6 
 
 		 610 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.79 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  23.46 
 
 		 788 aa  70.5  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  21.56 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  25.62 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  24.69 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  29.19 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>