24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_605 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  100 
 
 
646 aa  1355    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  28.31 
 
 
597 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  29.21 
 
 
601 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  29.46 
 
 
788 aa  101  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  22.45 
 
 
607 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  25 
 
 
610 aa  98.6  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  23.94 
 
 
610 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  24.51 
 
 
592 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  33.66 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  25.23 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  23.45 
 
 
342 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1933  hypothetical protein  24 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262327  hitchhiker  0.000000452368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1377  DnaB domain protein helicase domain protein  22.79 
 
 
437 aa  50.8  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0470845  hitchhiker  0.00000000022728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  23.84 
 
 
531 aa  50.8  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1028  DnaB domain protein helicase domain protein  23.33 
 
 
341 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  26.7 
 
 
712 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  25.91 
 
 
712 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  31.53 
 
 
712 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30.53 
 
 
716 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 
466 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  23.67 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  23.14 
 
 
469 aa  44.3  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 
907 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G33  putative replicative helicase  21.6 
 
 
275 aa  43.9  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>