137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2145 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  51.55 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  51.92 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  48.12 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  46.91 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  46.91 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  41.61 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  44.8 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  40.67 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  44.8 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  39.47 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  40.67 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  40.46 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  42.4 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  37.42 
 
 		 149 aa  87.8  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  47.46 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  44.62 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  40.38 
 
 		 176 aa  84.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  34.57 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  39.75 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  43.59 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  38.98 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  39.37 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  41.03 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  30.34 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  47.73 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.38 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  40.83 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  40.83 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  37.76 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  37.76 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  39.16 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  33.65 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.71 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  42.97 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.97 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  36.17 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  31.85 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.97 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  43.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  44.12 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  44.12 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  44.12 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  44.12 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  44.12 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  30.46 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  38.32 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  28.36 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  28.36 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  28.36 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  44.44 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.82 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  29.57 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  33.86 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  38.84 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  30.85 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  31.4 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  30.85 
 
 		 184 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  34.15 
 
 		 209 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  28.78 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  34.41 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  34.92 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  27.34 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.99 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  31.91 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  35.48 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  34.51 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  31.9 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  32.63 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  32.77 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1270  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  31.07 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  33.68 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  28.31 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  32.41 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  31.53 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  32.41 
 
 		 200 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  34.38 
 
 		 211 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  30.15 
 
 		 245 aa  44.3  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  33.68 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  29.47 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  29.57 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  32.29 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  31.36 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  31.93 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>