More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1896 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  76.67 
 
 
225 aa  337  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  76.19 
 
 
225 aa  337  9e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  48.95 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  48.95 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  48.42 
 
 
195 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  48.65 
 
 
194 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  49.44 
 
 
193 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  49.44 
 
 
193 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  51.14 
 
 
195 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  53.9 
 
 
194 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  53.9 
 
 
194 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  49.38 
 
 
193 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  47.83 
 
 
193 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  47.83 
 
 
193 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  50 
 
 
195 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  47.83 
 
 
193 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  53.5 
 
 
195 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  50 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  50 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  50 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  50 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  47.73 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  50 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  48.57 
 
 
194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  47.73 
 
 
192 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  46.81 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  52.87 
 
 
195 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  48 
 
 
194 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  47.73 
 
 
193 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  46.52 
 
 
195 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  46.02 
 
 
201 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  50.61 
 
 
194 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  47.19 
 
 
193 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  48.11 
 
 
200 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  47.25 
 
 
194 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  45.36 
 
 
199 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  48.3 
 
 
193 aa  177  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  46.07 
 
 
189 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  47.19 
 
 
195 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  47.43 
 
 
194 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  50.93 
 
 
186 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  45.56 
 
 
185 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  45.14 
 
 
181 aa  174  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  52.15 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  50.31 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  48.37 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  44 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  49.69 
 
 
207 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  44.19 
 
 
177 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  45.45 
 
 
186 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  47.13 
 
 
195 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  47.73 
 
 
190 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  46.82 
 
 
178 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  50.96 
 
 
206 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.37 
 
 
196 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  44.13 
 
 
193 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  45.71 
 
 
200 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  44.89 
 
 
199 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  45.71 
 
 
199 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  42.61 
 
 
188 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  48.15 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  48.82 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  50.64 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  43.75 
 
 
197 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  48.3 
 
 
195 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  46.7 
 
 
197 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  43.72 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  49.34 
 
 
182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  49.01 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  44.89 
 
 
195 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  42.86 
 
 
192 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  47.53 
 
 
200 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  44.83 
 
 
210 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  44.32 
 
 
197 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  47.53 
 
 
200 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  43.43 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  42.33 
 
 
192 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  46.01 
 
 
180 aa  161  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  42.86 
 
 
192 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  47.13 
 
 
235 aa  161  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  42.13 
 
 
193 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  47.13 
 
 
200 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  42.13 
 
 
190 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  43.82 
 
 
192 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  45.45 
 
 
199 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  46.95 
 
 
197 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  42.61 
 
 
201 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  43.26 
 
 
182 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  45.73 
 
 
198 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  45.86 
 
 
197 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  42.86 
 
 
192 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  40.91 
 
 
198 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  47.47 
 
 
196 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  41.01 
 
 
190 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  42.05 
 
 
189 aa  158  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  43.85 
 
 
198 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>