More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2020 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2689  hypothetical protein  59.44 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0257204  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  51.12 
 
 
184 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  51.12 
 
 
184 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  47.75 
 
 
185 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  48.31 
 
 
184 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  47.19 
 
 
230 aa  180  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  53.8 
 
 
200 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  53.12 
 
 
180 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  43.52 
 
 
225 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  45.79 
 
 
194 aa  174  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  48.85 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  43.01 
 
 
225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  47.98 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  45.81 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  46.41 
 
 
194 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  46.41 
 
 
194 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  49.73 
 
 
198 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  49.16 
 
 
180 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  54.3 
 
 
200 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  47.13 
 
 
197 aa  168  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  50.31 
 
 
200 aa  167  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  49.69 
 
 
200 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  50.29 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  49.03 
 
 
199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  45.71 
 
 
194 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  49.03 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  53.9 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  49.7 
 
 
194 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  42.63 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  48.89 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  47.98 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  49.37 
 
 
206 aa  161  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  48.52 
 
 
179 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  42.51 
 
 
178 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  52.05 
 
 
210 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  43.89 
 
 
204 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  44.94 
 
 
196 aa  159  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  40.68 
 
 
193 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  46.29 
 
 
193 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  49.66 
 
 
200 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  50.34 
 
 
211 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  41.67 
 
 
186 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  43.43 
 
 
194 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  46.07 
 
 
196 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  45.14 
 
 
193 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  45.14 
 
 
193 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  45.14 
 
 
193 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  54.3 
 
 
193 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  45.4 
 
 
207 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  45.4 
 
 
207 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  44.57 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  51.02 
 
 
201 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  43.93 
 
 
193 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  51.7 
 
 
200 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  41.81 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  47.47 
 
 
199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  44.51 
 
 
182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  48.7 
 
 
197 aa  154  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  47.13 
 
 
203 aa  154  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  51.92 
 
 
195 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  48.05 
 
 
197 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  43.68 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  44 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  51.28 
 
 
195 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  42.26 
 
 
178 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  43.43 
 
 
194 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  54.49 
 
 
195 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  42.86 
 
 
195 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  49.01 
 
 
186 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  47.14 
 
 
177 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  47.37 
 
 
201 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  40.78 
 
 
192 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  46.63 
 
 
205 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  45.45 
 
 
196 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  46.75 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  41.71 
 
 
198 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  42.53 
 
 
217 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  45.41 
 
 
195 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  45.45 
 
 
181 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  42.47 
 
 
195 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  46.75 
 
 
195 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  46.75 
 
 
195 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  46.75 
 
 
195 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  46.75 
 
 
195 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  46.75 
 
 
195 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  43.21 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2655  hypothetical protein  43.41 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  46.51 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  40.96 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  46.51 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  44.72 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  41.18 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  51.66 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  42.7 
 
 
195 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  46.2 
 
 
193 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  41.62 
 
 
190 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  43.82 
 
 
195 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  45.31 
 
 
337 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  43.21 
 
 
235 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>