More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1454 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  75.28 
 
 
184 aa  293  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  70.22 
 
 
181 aa  274  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  65.54 
 
 
177 aa  263  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  63.84 
 
 
178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  62.98 
 
 
189 aa  249  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  50.29 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  45.86 
 
 
194 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  46.02 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  51.57 
 
 
196 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  46.55 
 
 
192 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  49.11 
 
 
194 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.82 
 
 
201 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  43.26 
 
 
193 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  42.61 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  44.63 
 
 
194 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  44.2 
 
 
194 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  46.82 
 
 
193 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  44.89 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  45.66 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  43.93 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  47.34 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  47.34 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  47.34 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  45.09 
 
 
193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  43.82 
 
 
195 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  44.89 
 
 
194 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  44.38 
 
 
190 aa  161  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  45.57 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  43.5 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  46.2 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  46.75 
 
 
194 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  43.82 
 
 
198 aa  160  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  45.66 
 
 
194 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  45.09 
 
 
194 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  43.26 
 
 
230 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  43.5 
 
 
195 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  44.07 
 
 
195 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  43.82 
 
 
195 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  44.25 
 
 
186 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  45.09 
 
 
194 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  43.93 
 
 
195 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  47.24 
 
 
186 aa  158  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  43.35 
 
 
195 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  43.35 
 
 
195 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  43.35 
 
 
195 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  43.35 
 
 
195 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  44.69 
 
 
197 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  43.93 
 
 
195 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  43.35 
 
 
195 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  45.16 
 
 
200 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  48.73 
 
 
337 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  45.62 
 
 
211 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  43.35 
 
 
197 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  40.22 
 
 
199 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  45.03 
 
 
200 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  42.35 
 
 
225 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  44.89 
 
 
195 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  42.05 
 
 
199 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  42.2 
 
 
195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  43.93 
 
 
196 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  39.66 
 
 
182 aa  153  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  43.03 
 
 
225 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  41.38 
 
 
198 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  42.13 
 
 
193 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  42.61 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  41.57 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  46.71 
 
 
185 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  41.81 
 
 
180 aa  151  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  46.82 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  44.32 
 
 
193 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  42.46 
 
 
199 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  40.91 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  44.38 
 
 
210 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  46.37 
 
 
194 aa  149  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  43.2 
 
 
188 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  42.69 
 
 
195 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  44.38 
 
 
200 aa  148  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  45.73 
 
 
199 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  45.62 
 
 
193 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  41.99 
 
 
191 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  40.96 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  43.75 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  37.5 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  50.34 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  36.93 
 
 
188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  36.93 
 
 
188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  40.91 
 
 
217 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  39.77 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  39.11 
 
 
205 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  39.11 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  45.61 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  44.51 
 
 
195 aa  144  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2689  hypothetical protein  46.02 
 
 
194 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0257204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  37.16 
 
 
200 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>