More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0971 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  61.19 
 
 
207 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  62.5 
 
 
217 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  63.68 
 
 
207 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  61 
 
 
200 aa  260  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  63.74 
 
 
206 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  60.5 
 
 
235 aa  256  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  60.1 
 
 
205 aa  251  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  52.45 
 
 
200 aa  217  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  53.47 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  53.48 
 
 
200 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  54.95 
 
 
211 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  51.96 
 
 
201 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  52.33 
 
 
200 aa  203  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  55.49 
 
 
199 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  54.95 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  52.33 
 
 
198 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  50.75 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  51.23 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  52 
 
 
197 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  49.15 
 
 
217 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4183  hypothetical protein  54.4 
 
 
202 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  53.07 
 
 
197 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  54.24 
 
 
182 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  46.77 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  49.47 
 
 
196 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  46.41 
 
 
193 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  50.59 
 
 
196 aa  168  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  167  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  43.08 
 
 
197 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  49.38 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  49.38 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  49.38 
 
 
193 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  49.38 
 
 
193 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  52.38 
 
 
196 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  49.69 
 
 
197 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  48.77 
 
 
194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1911  hypothetical protein  51.14 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  46.41 
 
 
194 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  47.65 
 
 
193 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  48.15 
 
 
194 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  48.15 
 
 
194 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  48.24 
 
 
195 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  44.68 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  44.68 
 
 
195 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  44.68 
 
 
195 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  45.45 
 
 
230 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  44.68 
 
 
195 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  44.92 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  44.68 
 
 
195 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  44.68 
 
 
195 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  47.51 
 
 
198 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.32 
 
 
201 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  44.1 
 
 
193 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  44.09 
 
 
193 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  47.24 
 
 
180 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  48.92 
 
 
195 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  45.3 
 
 
199 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  46.5 
 
 
185 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  44.44 
 
 
197 aa  158  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  45.11 
 
 
200 aa  158  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  48.12 
 
 
186 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  44.25 
 
 
178 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  44.58 
 
 
184 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  47.53 
 
 
194 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  44.58 
 
 
184 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  42.93 
 
 
186 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  44.5 
 
 
193 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  45.56 
 
 
195 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  47.47 
 
 
193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  42.02 
 
 
189 aa  154  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  44.69 
 
 
193 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  44.69 
 
 
181 aa  154  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  48.41 
 
 
190 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  41.21 
 
 
184 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  45.22 
 
 
179 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  45.09 
 
 
192 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  41.24 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  45.68 
 
 
194 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  45.68 
 
 
194 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  46.95 
 
 
195 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  47.53 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  39.23 
 
 
188 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  45.73 
 
 
204 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  39.23 
 
 
188 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  42.46 
 
 
182 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  46.3 
 
 
194 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  46.96 
 
 
194 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  39.66 
 
 
188 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  43.18 
 
 
225 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  46.63 
 
 
195 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  46.63 
 
 
195 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  47.74 
 
 
225 aa  147  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  46.15 
 
 
198 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  44.38 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  41.4 
 
 
195 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  46.25 
 
 
186 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>