More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3369 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  89.45 
 
 		 199 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  79.4 
 
 		 211 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  73 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  72.64 
 
 		 201 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  69.65 
 
 		 200 aa  295  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  72.64 
 
 		 210 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  62.77 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4183  hypothetical protein  63.86 
 
 		 202 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  63.13 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  53.03 
 
 		 200 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  56.91 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  54.36 
 
 		 200 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  54.45 
 
 		 200 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  53.54 
 
 		 200 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  57.69 
 
 		 198 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  54.45 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  54.05 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  53.47 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  55.43 
 
 		 207 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  55.43 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  51.93 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  52.72 
 
 		 205 aa  197  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  46.91 
 
 		 193 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  46.39 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  46.39 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  46.39 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  54.44 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1911  hypothetical protein  55.25 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  45.64 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  45.7 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  45.64 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  50 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  47.59 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  48.81 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  45.99 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  47.46 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  45.55 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  45 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  47.4 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  48.39 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  46.24 
 
 		 196 aa  178  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  47.31 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  47.12 
 
 		 193 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  47.85 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  47.85 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  44.85 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  46.24 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  46.24 
 
 		 195 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  47.16 
 
 		 193 aa  174  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  46.15 
 
 		 194 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  45.66 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  45.66 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  45.66 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  45.66 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  45.66 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  47.69 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  47.95 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.48 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  49.21 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  47.98 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  42.86 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  47.18 
 
 		 195 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  42.78 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.07 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  43.89 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  44.51 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  42.78 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  46.24 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  47.17 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  44.51 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  47.17 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  44.32 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  44.89 
 
 		 230 aa  168  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  41.24 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  46.2 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  44 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  45.25 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  45.56 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  49.03 
 
 		 193 aa  164  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  43.26 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  42.39 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  48.6 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  46.79 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  44.75 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  44.94 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  47.4 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  41.76 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  43.89 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  41.21 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  50.64 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  43.48 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  41.44 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  40.22 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  43.2 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  48.86 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  45.81 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  48.8 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>