More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1920 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  97.33 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  76.67 
 
 
230 aa  337  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  47.46 
 
 
193 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  44.39 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  50.32 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  49.09 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  49.09 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  43.01 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  49.09 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  49.4 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  45.6 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  47.27 
 
 
193 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  47.95 
 
 
193 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  52.53 
 
 
180 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  48.48 
 
 
194 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  48.48 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  45.76 
 
 
194 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  45.51 
 
 
189 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  47.73 
 
 
195 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.65 
 
 
201 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  48.52 
 
 
186 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  46.63 
 
 
195 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  47.16 
 
 
195 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  45.98 
 
 
195 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  47.4 
 
 
195 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  47.4 
 
 
195 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  47.4 
 
 
195 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  47.4 
 
 
195 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  47.4 
 
 
195 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  47.02 
 
 
192 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  46.07 
 
 
195 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  46.82 
 
 
195 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  44.63 
 
 
194 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  43.75 
 
 
194 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  47.71 
 
 
195 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  49.04 
 
 
194 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  46.63 
 
 
200 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  47.06 
 
 
193 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  43.18 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  44.75 
 
 
207 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  43.58 
 
 
185 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  44.25 
 
 
181 aa  165  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  46.41 
 
 
188 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  44.13 
 
 
193 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  43.24 
 
 
195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  44.2 
 
 
207 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  42.53 
 
 
184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  44.51 
 
 
178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  50.32 
 
 
206 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  44.62 
 
 
196 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  47.4 
 
 
193 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  44.51 
 
 
217 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  45.73 
 
 
199 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  41.21 
 
 
199 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  42.7 
 
 
197 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  42.94 
 
 
200 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  48.41 
 
 
190 aa  158  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  43.68 
 
 
188 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  43.68 
 
 
188 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  42.53 
 
 
193 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  43.22 
 
 
205 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  43.18 
 
 
182 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  44.13 
 
 
196 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  43.35 
 
 
199 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  40.59 
 
 
177 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  42.59 
 
 
190 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  46.29 
 
 
197 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  44.51 
 
 
198 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  42.35 
 
 
182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  40.91 
 
 
189 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  42.46 
 
 
204 aa  154  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  43.39 
 
 
203 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  47.47 
 
 
180 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  39.43 
 
 
198 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  44.15 
 
 
195 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  41.36 
 
 
190 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  41.34 
 
 
196 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  42.86 
 
 
180 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  40.96 
 
 
188 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  42.7 
 
 
192 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  42.2 
 
 
211 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  45.68 
 
 
195 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  45.06 
 
 
200 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  42.7 
 
 
192 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5525  hypothetical protein  44.07 
 
 
183 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  40.51 
 
 
235 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  44.85 
 
 
197 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  46.33 
 
 
194 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  46.75 
 
 
210 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  40.24 
 
 
178 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  40.86 
 
 
200 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>