More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2645 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  51.09 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  51.32 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  54.55 
 
 		 440 aa  168  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  46.63 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  45.56 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  47.62 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  43.65 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  46.63 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  44.38 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  47.16 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  49.03 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  41.99 
 
 		 182 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  42.39 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  49.15 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  43.41 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  49.15 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  49.15 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  44.69 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  46.45 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  46.75 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  41.3 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  47.74 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  47.4 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  47.1 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  44.71 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  49.32 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  45.3 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  42.78 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  47.1 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  48.39 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  44.83 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  46.45 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  45.16 
 
 		 194 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  44.52 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  49.68 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  49.68 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  44.59 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  42.78 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  49.68 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  41.75 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  40.88 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  45.22 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  45.1 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  45.1 
 
 		 200 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  45.16 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  41.57 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  44.52 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  41.75 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  41.86 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  44.52 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  44.07 
 
 		 195 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  46.94 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  46.94 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  44.3 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  44.52 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  49.43 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  44.83 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  47.09 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  43.32 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  40.43 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  46.33 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  41.44 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  46.9 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  41.71 
 
 		 225 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  44.69 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  39.33 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  39.33 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  43.4 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  41.57 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  46.84 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  48.57 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  41.71 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  44.77 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  42.41 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  48.94 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  45.39 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  46.9 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  46.9 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  40.22 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  39.47 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  42.41 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  36.32 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  42.04 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  44.83 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  42.68 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  44.52 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  47.1 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  40.98 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1911  hypothetical protein  45.6 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  35.61 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  54.05 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  41.77 
 
 		 217 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  41.4 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  43.23 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  43.23 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  37.34 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  43.23 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  41.77 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>