More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4238 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  78.33 
 
 
185 aa  288  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  78.57 
 
 
187 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  69.89 
 
 
187 aa  255  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  63.79 
 
 
187 aa  201  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  58.38 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  57.47 
 
 
180 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  57.65 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  53.53 
 
 
191 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  54.39 
 
 
181 aa  161  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  47.22 
 
 
194 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  57.31 
 
 
197 aa  158  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  58.82 
 
 
198 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  54.19 
 
 
200 aa  157  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  156  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  53.53 
 
 
195 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  49.11 
 
 
186 aa  153  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  49.68 
 
 
195 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  47.7 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  56.29 
 
 
198 aa  151  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  49.15 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  45.2 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  45.2 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  47.44 
 
 
197 aa  144  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  44.2 
 
 
194 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  45.4 
 
 
194 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  43.65 
 
 
194 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  44.58 
 
 
194 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  50.64 
 
 
207 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  47.19 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  50.64 
 
 
440 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  44.89 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  43.35 
 
 
201 aa  138  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.01 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  42.22 
 
 
196 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  39.39 
 
 
198 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  50.63 
 
 
203 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  47.24 
 
 
193 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  42.53 
 
 
193 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  44.31 
 
 
193 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  43.79 
 
 
193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  43.58 
 
 
195 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  47.24 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1144  conserved hypothetical protein 730  47.95 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263245  decreased coverage  0.00451054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  47.24 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  47.24 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  47.24 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  44.13 
 
 
195 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  44.13 
 
 
195 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  44.17 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  42.93 
 
 
197 aa  131  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  46.63 
 
 
194 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  46.63 
 
 
194 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  44.17 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  44.17 
 
 
194 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  42.39 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  44.17 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  39.18 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  44.24 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  44.51 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.73 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  44.24 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  39.05 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  43.86 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  44.08 
 
 
184 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  43.86 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  39.53 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  44.08 
 
 
184 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  41.57 
 
 
200 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  43.93 
 
 
194 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  38.24 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  44.08 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  40.35 
 
 
210 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  45.71 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  43.37 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  46.15 
 
 
180 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  46.71 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  39.66 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  36.87 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  40.45 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  40.22 
 
 
193 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  42.94 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  39.41 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  40.59 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  43.56 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  43.14 
 
 
201 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  40.33 
 
 
186 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  124  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  41.32 
 
 
185 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  38.82 
 
 
184 aa  124  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.29 
 
 
193 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>