More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3118 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  75.85 
 
 
197 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  75.85 
 
 
197 aa  322  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  70.53 
 
 
197 aa  297  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  70.74 
 
 
196 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  68.6 
 
 
197 aa  263  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  61.27 
 
 
200 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  59.31 
 
 
203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  52.38 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  48.97 
 
 
194 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  50.8 
 
 
194 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  50.8 
 
 
194 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  54.01 
 
 
195 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  52.54 
 
 
194 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  54.59 
 
 
195 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  53.19 
 
 
194 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  54.89 
 
 
195 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  52.72 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  51.09 
 
 
195 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  51.09 
 
 
195 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  49.46 
 
 
193 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  49.46 
 
 
193 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  46.39 
 
 
194 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  48.11 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  48.11 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  48.11 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  48.11 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  46.74 
 
 
194 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  48.11 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  48.65 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  48.11 
 
 
195 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  48.91 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  48.91 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  48.37 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  51.65 
 
 
180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  48.37 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  47.57 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  47.51 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  48.37 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  50.57 
 
 
196 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  45.65 
 
 
194 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  48.24 
 
 
201 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  48.89 
 
 
192 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  48.89 
 
 
185 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  47.28 
 
 
190 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  46.2 
 
 
193 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  51.87 
 
 
196 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  45.65 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  49.73 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  48.65 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  46.23 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  50.26 
 
 
189 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  50.56 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  48.63 
 
 
196 aa  161  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  46.7 
 
 
198 aa  161  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  47.87 
 
 
199 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  40.86 
 
 
189 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  46.45 
 
 
195 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  44.79 
 
 
182 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  50.27 
 
 
193 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  49.18 
 
 
193 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  45.99 
 
 
200 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  51.38 
 
 
195 aa  158  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  45.65 
 
 
192 aa  158  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  52.45 
 
 
186 aa  158  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  55.94 
 
 
211 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  44.57 
 
 
192 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  53.9 
 
 
197 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  44.57 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  45.11 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  44.02 
 
 
192 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  53.9 
 
 
200 aa  154  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  44.02 
 
 
192 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  46.73 
 
 
200 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  53.9 
 
 
197 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  44.02 
 
 
192 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  44.02 
 
 
192 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  44.02 
 
 
192 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  46.53 
 
 
200 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  48.61 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  46.04 
 
 
200 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  43.48 
 
 
192 aa  151  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0005  hypothetical protein  41.08 
 
 
188 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.464178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  52.48 
 
 
201 aa  151  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  44.57 
 
 
179 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  40.98 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  46.74 
 
 
180 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  48.47 
 
 
205 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  52.45 
 
 
192 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  44.38 
 
 
188 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  49.19 
 
 
193 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1270  hypothetical protein  45.09 
 
 
192 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  45.86 
 
 
197 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  43.08 
 
 
200 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  50.68 
 
 
206 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  47.43 
 
 
210 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  54.61 
 
 
199 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>