227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0005 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0005  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.464178  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  41.08 
 
 
207 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  41.08 
 
 
194 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  41.08 
 
 
194 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  43.93 
 
 
193 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  40.56 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  39.2 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  41.38 
 
 
196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  41.04 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  38.64 
 
 
195 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  39.31 
 
 
195 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  41.14 
 
 
197 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  41.01 
 
 
194 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  37.84 
 
 
194 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  41.57 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  41.94 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  38.07 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  41.57 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  40.46 
 
 
196 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  40.11 
 
 
189 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  40.48 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  39.2 
 
 
193 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  39.77 
 
 
194 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  39.77 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  38.46 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  38.46 
 
 
195 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  39.2 
 
 
193 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  39.2 
 
 
193 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  39.2 
 
 
193 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  39.2 
 
 
193 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  40.11 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  37.91 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  37.91 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  38.86 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  37.91 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  37.91 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  37.91 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  37.36 
 
 
195 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  40.36 
 
 
235 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  36.93 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  36.93 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  38.73 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  40.25 
 
 
201 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  36.87 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  42.76 
 
 
186 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  37.65 
 
 
192 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  37.22 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  41.71 
 
 
197 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  37.36 
 
 
195 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  38.71 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  38.06 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  41.51 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  38.96 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  39.49 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  37.71 
 
 
203 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  40.99 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.16 
 
 
186 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  37.42 
 
 
200 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  39.35 
 
 
211 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  35.23 
 
 
195 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  36.13 
 
 
201 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  36.36 
 
 
206 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  37.57 
 
 
193 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  36.7 
 
 
200 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  38.71 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  37.42 
 
 
199 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  39.88 
 
 
197 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  38.71 
 
 
195 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  38.15 
 
 
193 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  40.38 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  36.93 
 
 
192 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  34.59 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  35.63 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  40 
 
 
188 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  36.47 
 
 
180 aa  117  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1393  hypothetical protein  38.06 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.14 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  36.54 
 
 
230 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  36.67 
 
 
193 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  36.77 
 
 
198 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  37.65 
 
 
185 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  38.06 
 
 
197 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1885  hypothetical protein  34.1 
 
 
189 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  38.06 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  38.06 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  38.06 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  35.96 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  35.39 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  31.64 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  38.06 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  38.06 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  38.06 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>