217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1885 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2655  hypothetical protein  53.48 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  52.41 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  52.41 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  49.73 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  49.73 
 
 		 195 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  49.73 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  50.53 
 
 		 195 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  45.45 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  48.13 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  48.96 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  47.59 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  47.59 
 
 		 193 aa  170  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  44.39 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  46.33 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  49.73 
 
 		 189 aa  164  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  47.06 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  43.85 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  45.95 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  48.07 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  48.91 
 
 		 192 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  44.92 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  43.85 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  45.45 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  44.92 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  44.39 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  42.25 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  43.09 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  43.09 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  44.92 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  44.92 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  43.32 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  43.85 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  42.02 
 
 		 193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  43.85 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  43.85 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  43.85 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  43.85 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  43.32 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  43.85 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  42.02 
 
 		 193 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  42.02 
 
 		 193 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  51.4 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  44.69 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  42.78 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  41.49 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  41.71 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  48.13 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  44.39 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  42.93 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  48.66 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  46.52 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  40.96 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  41.49 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  43.01 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  41.48 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  46.52 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  40.96 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  37.43 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  39.89 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  42.27 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  41.99 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  45.41 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  40.96 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  40.96 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  40.96 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  40.43 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  40.96 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  41.9 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  40.96 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  44.75 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  40.43 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  45.09 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1270  hypothetical protein  46.33 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  47.03 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  45.2 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  44.63 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  44.32 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  39.57 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  39.33 
 
 		 182 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  43.23 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  35.29 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  46.37 
 
 		 337 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  44.79 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  47.03 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  47.75 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  42.61 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  44.17 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  41.99 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.5 
 
 		 221 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  36.41 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  40.33 
 
 		 205 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  40.35 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  34.09 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  42.08 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  35.83 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>