243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0404 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1393  hypothetical protein  56.91 
 
 		 195 aa  237  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  43.24 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  42.22 
 
 		 186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  39.57 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  41.71 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  41.49 
 
 		 190 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  39.57 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  39.04 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  38.92 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  38.5 
 
 		 193 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  39.57 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  39.04 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  39.04 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  39.57 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  39.04 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  39.04 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  39.04 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  39.04 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  39.04 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  39.04 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.89 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  39.04 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  40.86 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  37.43 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  38.17 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  37.97 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  39.25 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  141  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  36.9 
 
 		 194 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  41.1 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  41.04 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.8 
 
 		 198 aa  139  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  36.9 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  41.98 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  37.57 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  41.36 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  40.11 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  40.78 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  34.24 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  43.23 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  38.15 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  40.78 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  38.54 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  41.29 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  35.83 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  37.78 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1885  hypothetical protein  38.5 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  39.18 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  36.41 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  41.88 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  34.64 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  36.22 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  43.31 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  35.8 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  39.39 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  35.8 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  35.56 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  34.22 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  37.43 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  34.22 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  33.16 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  39.64 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  36.93 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  36.67 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  36.63 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  34.76 
 
 		 195 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2655  hypothetical protein  32.8 
 
 		 193 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  34.76 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  38.5 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  36.67 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  35.52 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  38.27 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  37.06 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  38.27 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  36.11 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  35.37 
 
 		 178 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0328  hypothetical protein  40.54 
 
 		 189 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0335495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  40.76 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  32.62 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  36.17 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  37.89 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  34.43 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  35.83 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  36.81 
 
 		 337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  39.66 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>