More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_79930 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  100 
 
 
223 aa  463  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06548  lysine decarboxylase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G04800)  41.1 
 
 
247 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.325413  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  42.45 
 
 
200 aa  174  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  39.81 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07925  conserved hypothetical protein  38.98 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305938  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  39.32 
 
 
199 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  40.76 
 
 
200 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  38.05 
 
 
194 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  40.28 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  40.91 
 
 
197 aa  154  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  38.05 
 
 
194 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  41 
 
 
201 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  39.07 
 
 
192 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  37.56 
 
 
194 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  40.31 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  41.55 
 
 
197 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  42.35 
 
 
200 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.79 
 
 
198 aa  152  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  38.54 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  37.68 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  38.73 
 
 
193 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  40.29 
 
 
199 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  37.07 
 
 
193 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  38.6 
 
 
192 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  37.56 
 
 
193 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  40.31 
 
 
194 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  38.92 
 
 
195 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  39.9 
 
 
200 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  37.07 
 
 
193 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  37.07 
 
 
193 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  37.07 
 
 
193 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  39.47 
 
 
194 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  40.2 
 
 
217 aa  147  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  38.32 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  38.54 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  38.14 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  35.81 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  38.31 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  37.67 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  36.87 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  41.33 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  42.08 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  43.89 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  35.81 
 
 
194 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  38.21 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  37.38 
 
 
192 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  37.21 
 
 
192 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  36.59 
 
 
193 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  37.67 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  41.33 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  37.32 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  37.44 
 
 
196 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  37.56 
 
 
192 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  37.21 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  37.21 
 
 
192 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  37.44 
 
 
185 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  37.21 
 
 
192 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  35.12 
 
 
193 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  37.21 
 
 
192 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  37.44 
 
 
197 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03440  conserved hypothetical protein  36.92 
 
 
512 aa  143  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00118084  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  39.15 
 
 
205 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  39.8 
 
 
181 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  36.59 
 
 
195 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  37.21 
 
 
193 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  35.65 
 
 
201 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  36.82 
 
 
194 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  38.12 
 
 
197 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  36.59 
 
 
195 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  39.59 
 
 
178 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  36.95 
 
 
195 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  36.45 
 
 
195 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  36.45 
 
 
195 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  36.45 
 
 
195 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  36.45 
 
 
195 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  36.45 
 
 
195 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  41.33 
 
 
211 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  38.17 
 
 
195 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  36.68 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  37.19 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  41.12 
 
 
199 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  37.13 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  38.05 
 
 
196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  36.95 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  36.82 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  38.28 
 
 
186 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4183  hypothetical protein  40.87 
 
 
202 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  36.82 
 
 
177 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  34.95 
 
 
197 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  43.09 
 
 
194 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  36.82 
 
 
203 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  38.42 
 
 
193 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  36.18 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>