More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3769 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  894    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  93.41 
 
 		 186 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.71 
 
 		 248 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  52.75 
 
 		 251 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  54.55 
 
 		 191 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  51.11 
 
 		 249 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  50.99 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  53.66 
 
 		 193 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  47.46 
 
 		 204 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  49.75 
 
 		 253 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 253 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 		 253 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  46.63 
 
 		 194 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  50.5 
 
 		 253 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 255 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  54.8 
 
 		 262 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 270 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 		 253 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  45.51 
 
 		 194 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  45.51 
 
 		 194 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  46.37 
 
 		 184 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.89 
 
 		 253 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  47.46 
 
 		 191 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.44 
 
 		 252 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 		 253 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  45.66 
 
 		 194 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 		 252 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  46.11 
 
 		 192 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  50.86 
 
 		 185 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  46.7 
 
 		 195 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  46.67 
 
 		 178 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  44.94 
 
 		 194 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  44.94 
 
 		 193 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  45.71 
 
 		 194 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 		 282 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  44.94 
 
 		 194 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  46.41 
 
 		 194 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  45.36 
 
 		 204 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  46.15 
 
 		 195 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  45.71 
 
 		 194 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  44.38 
 
 		 193 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  44.38 
 
 		 193 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  45.14 
 
 		 182 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 		 253 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 		 248 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  43.82 
 
 		 193 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  43.82 
 
 		 193 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  51.28 
 
 		 199 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.7 
 
 		 253 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 		 256 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.6 
 
 		 252 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 258 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 		 258 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  43.89 
 
 		 193 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 250 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  43.82 
 
 		 195 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  45.66 
 
 		 195 aa  156  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 195 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 195 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  43.26 
 
 		 195 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 195 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 195 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  43.75 
 
 		 177 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 195 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  50.64 
 
 		 188 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.38 
 
 		 249 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  52.32 
 
 		 199 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  43.96 
 
 		 195 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  50.64 
 
 		 188 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  50.64 
 
 		 188 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  46.41 
 
 		 189 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  46.88 
 
 		 217 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.51 
 
 		 193 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  43.89 
 
 		 197 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  49.69 
 
 		 201 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  42.13 
 
 		 195 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.06 
 
 		 196 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 		 253 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  45.98 
 
 		 180 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  43.02 
 
 		 195 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 		 252 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 		 258 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  48.28 
 
 		 253 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 		 258 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 272 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  44.94 
 
 		 197 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  45.65 
 
 		 197 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 		 258 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  46.3 
 
 		 181 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 		 252 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  52.32 
 
 		 211 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  42.7 
 
 		 197 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  45.56 
 
 		 256 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 267 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  45.45 
 
 		 200 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  55.03 
 
 		 187 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  44.94 
 
 		 197 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>