213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2033 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  298  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  52.11 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  49.64 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  44.08 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  46.05 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  45.39 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  52.8 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  46.31 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  49.66 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  45.77 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  40.67 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  43.51 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  52.05 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  41.55 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  49.3 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  39.73 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  52.03 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  47.02 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  39.34 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  47.3 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  42.14 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  42.14 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  36.77 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  41.35 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  44.7 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  44.7 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  44.7 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  39.46 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  40.62 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  40.62 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  35.97 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  32.68 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  35.29 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.57 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  47.52 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  47.52 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  47.52 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  47.52 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  35.29 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  38.26 
 
 		 255 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  30.41 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  35.04 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  35.04 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  36.64 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  31.16 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  36.75 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  34.85 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  35.9 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  32.74 
 
 		 269 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  33.64 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  33.61 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  44.12 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  37.84 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  36.52 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  32.59 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  29.71 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  35.04 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  34.75 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  29.91 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  33.11 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  36.04 
 
 		 275 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  29.45 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  32.33 
 
 		 266 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  32.35 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  34.19 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  37.3 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  33.9 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  34.78 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  31.3 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  32.2 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  36.97 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  29.2 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  29.2 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  31.3 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  33.04 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  32.62 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  40.4 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  35.77 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  31.82 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.78 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  35.71 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  34.91 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  31.62 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  30.43 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  29.2 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  29.66 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>