67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7577 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7577  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  86.29 
 
 
201 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  86.29 
 
 
201 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  91.46 
 
 
175 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5902  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  60.69 
 
 
186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5679  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  60.69 
 
 
186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000903991  normal  0.0372691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.28 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  37.67 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  37.58 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.16 
 
 
161 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  36.18 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  36.18 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  33.1 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.29 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  30.83 
 
 
157 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  34.68 
 
 
146 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  29.73 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  32 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  31.29 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  29.5 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.46 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  33.81 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  32.1 
 
 
340 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  33.57 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  29.63 
 
 
171 aa  48.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  29.65 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  31.54 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  31.97 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  31.33 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  29.94 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  34.53 
 
 
157 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  27.92 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  29.5 
 
 
155 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  30.82 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1207  hypothetical protein  29.46 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  31.79 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  28.03 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.03 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  24.86 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  32.62 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  27.44 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  25.95 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  29.32 
 
 
245 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  28.28 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  30.87 
 
 
275 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  31.97 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  31.93 
 
 
217 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  28.67 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  28.47 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  31.54 
 
 
289 aa  41.6  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  33.9 
 
 
186 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  28.47 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  25.93 
 
 
174 aa  41.6  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  27.01 
 
 
269 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  26.96 
 
 
262 aa  41.2  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  28.99 
 
 
258 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  29.25 
 
 
166 aa  41.2  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>