161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0593 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  55.76 
 
 
171 aa  202  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  54.76 
 
 
171 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  51.16 
 
 
181 aa  177  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  52.94 
 
 
166 aa  175  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  39.51 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  34.59 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  32.68 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  36.24 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  37.9 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  36.03 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  31.94 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  30.07 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  28.31 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  38.14 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.87 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  38.54 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  34.11 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  34.88 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.65 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  32.19 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  33.83 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  34.29 
 
 
165 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.41 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  43.3 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  32.11 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  35.35 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  34.58 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  34.58 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  29.2 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  30.84 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  30.84 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  31.78 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  30.67 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  28.83 
 
 
176 aa  54.3  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  28.46 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  28.46 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  30.67 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  29.66 
 
 
245 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  29.84 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  30.69 
 
 
168 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  29.77 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  30.86 
 
 
191 aa  51.2  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  29.08 
 
 
240 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  27.54 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  29.92 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  31.62 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  28.87 
 
 
245 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  26.8 
 
 
261 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  28.24 
 
 
194 aa  48.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5741  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  23.75 
 
 
201 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6105  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  23.75 
 
 
201 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  24.14 
 
 
263 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  30.88 
 
 
197 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  27.15 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  27.12 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  26.47 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.19 
 
 
267 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  27.75 
 
 
241 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.35 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  29.03 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  32.77 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  25.95 
 
 
270 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  29.14 
 
 
210 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  27.93 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  28.23 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  23.24 
 
 
342 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  29.48 
 
 
207 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  29.27 
 
 
200 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  29.13 
 
 
266 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  27.78 
 
 
317 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  25.36 
 
 
243 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  29.09 
 
 
247 aa  44.3  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  29.47 
 
 
275 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  32.67 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  29.2 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  23.19 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  28.77 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  29.29 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  27.56 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6587  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  22.82 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237459  normal  0.0554296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  26.67 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  27.42 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  27.96 
 
 
252 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  26.67 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  27.96 
 
 
252 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  26.28 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  28.1 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>